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また，組み合わせというのはライブラリやアプリの組み合わせだけでなく，たとえば X11 に必要な機能と依存を全部削ぎ落とす，という複数のパッケージに跨るビルドの設定が config の変数に一単語書き加えるだけで可能なところが Portage の非常な利便性を示しています。
/etc/portage/make.conf に
USE="-X" とするだけです。
逆に X11 を有効化したければ
USE="X" でよいのです。