オブジェクトを削除した後にUNDOしてオブジェクトを復活させた際に、オブジェクト自体は戻ってきて再配置されるけど、触れない(マウスカーソルが★で選択モードにならないしどうやっても選択できないので削除もできない)という状態に「たまになる」というものです。
最初に発見した時はオーディオオブジェクトでしたが、MIDIオブジェクトでも起きた気がします。
一旦そうなると保存して開き直してもそのままなのでもうどうしようもなく、他のオブジェクトを新規トラックに待避させてトラックごと削除するしかありません。
最新版でも起きますね。UNDO100回に1回くらいの発生頻度だと思うので気づいていない人が多いかも。