自身がGitHubで管理しているいくつかのリポジトリのデフォルトブランチをmasterからmainに変更しました。当初はtrunkへの変更を検討をしていましたがGitHub社が管理されているリポジトリの多くがmainブランチをデフォルトブランチになっているようなので今後はこちらが主流になっていくだろうと判断しました。
また変更した後に気付きましたがmasterブランチを対象とするファイルやディレクトリ単位のURL (e.g. https://github.com/manaelproxy/manael/blob/master/README.md) からデフォルトブランチの同一パスへリダイレクトするようになっていますね。変更前はデッドリンクが発生してしまうことを危惧して影響が少なそうなリポジトリから変更していましたがデッドリンクの心配は不要そうで安心しました。